万福寺位于黄檗山麓，距福州约70公里，为全国重点寺庙。始建于唐德宗贞元五年（789年），此后，万福寺几经兴衰，至“文革”期间，寺宇毁坏尽。中共中央十一界三中全会之后，重修万福寺，使这个东南沿海名刹呈现新辉。

万福禅寺历代高僧辈出，尤其是隐元禅师，于清顺治十一年（1645年）东渡日本后，把建筑、雕塑、书法、印刷、医药、音乐等大量先进文化传入日本，并在日本发展黄檗禅宗，1867年，日本黄檗宗衍为十一派，嗣法者4648人，成了日本佛教的一大盛宗。黄檗山万福寺也因此而成为日本黄檗宗的祖庭。

现山门、天王殿、钟鼓楼、大雄宝殿、法堂、禅堂、隐元纪念堂等皆轮换一新。1997年12月8日，隆重举行重建落成暨佛像开光庆典。现寺中文物尚遗石槽三口，其中宋代一口有“僧淳生为四恩三有舍，庆历五年己酉（1045年）七月造，住持沙门复其”的题刻。

万福寺位于福清渔溪镇西北，一代高僧隐元禅师住持，使该寺一度成为东南沿海名刹和福建佛教文化中心。后隐元卒弟子东渡弘法，在日本京都建万福寺创立了黄柒宗，留下中日文化交流的佳话。